یکی از قدیمی ترین مساجد تاریخی ایران است که براساس برخی کتب تاریخی و سفرنامه ها به نظر می رسد بنای اولیه آن حدود 900 تا هزارسال پیش هزمان با ورود اسلام به خطه فارس ساخته شده است. کتیبه ای تاریخی از جنس چوب بر سر در مسجد نصب شده است که نشان می دهد مسجد اقلید در سال 849 ه. ق توسط فردی به نام عبدالعزیز احمد بن عبدالعزیز بن عقیل تعمیر شده است. به گواه نویسنده کتاب اقلید در دامن کوهساران سیدمهدی خیراندیش مسجدجامع یکی از شاخصه های مدنیت در شهر اقلید به شمار می رفته و با توجه به اینکه شهر بر سر راه تابستانی اقلید- شیرازقرار داشته هر جهانگرد و سفرنامه نویسی از این مسیر گذر کرده و وارد اقلید شده مسجد جامع را دیده و از آن یاد کرده است. پیشینه مسجد جامع اقلید بیش از 510 سال بوده است لذا قدمت این مسجد به همان سالهای ورود اسلام و پذیرش آن از طرف مردم اقلید باز می گردد. این مسجد در اواخر دهه 50 با همت آیت اله ابطحی و کمک مردم توسعه یافت و ساختمان آن مدرن تر و معماری جدید در آن اعمال شد. پس از انقلاب نیز ساختمان آن دچار تغییر و دگرگونی شد.
